新所得税法与原企业所得税条例比较，有以下几个显著的特点：一是内资企业、外资企业统一适用新所得税法；二是将原来的税率由33%降为25%；三是修改了原来的税收优惠政策，制定了新的税收优惠体系；四是内资和外资统一了税前扣除办法和标准。
目前所得税管理工作中存在的问题。
一是财务核算不规范。在所得税征收管理的要求下，企业不能按照现行的会计制度规定合理设置会计科目，不能按照会计处理程序正确核算各项经济业务，对各项成本费用列支把关不严、审核不力，导致乱摊成本、虚增虚列费用的现象时有发生。个别企业由于对所得税工作认识不足，重视程度不够，在存货管理上缺乏必要的管理制度，对各种存货的收发、结存没有完整的原始记录和收发手续，常常是物一堆，货一堆。一些新办企业的投资者以自己使用过的房屋、设备、运输工具等物资投资于企业，不能按照固定资产的核算要求，正确对固定资产进行计价，常常是高估固定资产价值，多提折旧。
二是建账建制方面缺乏必要的遵从意识和法律观念。这次调查过程中，我们发现企业在履行正常的财务制度上，表现出三个方面的不足：第一，财务制度执行不严，不能按照财务制度的规定处理有关会计事项，如在资金流通环节，不能严格按照现金管理规定，严格控制库存现金限额，大额现金交易相当普遍。第二，对企业财务人员管理不规范，由于有关部门对现行的会计执业资格缺少必要的监控和管理手段，致使部分会计从业人员，在不具备会计资格或未取得相应会计资格证书的情况下，从事会计职业。第三，法律观念淡簿，个别企业的财务人员或法人代表，为了获取不正当的个人或企业利益，不惜以身试法，用编制两套账或提供虚假记账凭证或销毁记账凭证的方式，借以掩盖收入，隐匿企业所得税。
三是行政事业单位应税收入控管难。根据现行所得税法的有关规定，对行政事业单位的有关经营所得要依法征收所得税。但是，就目前状况而言，税务机关对行政事业单位征收所得税的难度相当大。首先，监控难。由于大多数行政事业单位的经营所得在时间、地点和空间上存在着很大的不确定性，再加上纳税意识淡薄、行政手段干预等因素，致使税务机关很难掌握与其生产经营有关的纳税资料。其次是管理难。由于行政事业单位大部分游离于我们税务机关的税务登记管理之外，因此，税务机关对其实施税务检查手段、方式等相对弱化，再加上行政事业单位对应税所得的账务记载基本上是不完整、不全面，这也是造成税务机关管理难的一个重要原因。
四是新办企业所得税管理难。目前在查账征收、核定征收和定额征收的所得税管理方式下，由于每一种征收方式的鉴定，都是在企业的生产经营前期进行，税务机关核定出的征收方式，与企业后期的实际生产经营状况存在着很大的不一致性。同时，目前所得税征收方式的鉴定与地税部门不尽一致，使纳税人对税务机关执法的公正性产生质疑，影响了公平、公正的税务机关形象。由于核定的项目过多，纳税人资料又不齐全，很难给纳税人核定出一个合适的应税所得率。同时，由于应税所得率设置的过高，在一定程度上，制约着纳税人不断扩大再生产。近年来我们国税机关主要从事增值税纳税人管理，而对由地税部门管理的企业几乎很少涉及。在这种情况下，对新办非增值税的企业所得税管理，就相应给国税机关的管理和监控带来了一定的难度。
加强企业所得税管理的对策。
一是加强领导，健全组织机构。各基层所得税征管单位，要成立以“一把手”为组长的所得税管理领导小组，充实所得税岗位人员力量，不断加强对搞好所得税工作重要性的认识。同时，要加大对所得税工作的考核力度，扩大考核范围，提高考核分值，并建立健全所得税各项考核制度，保证把各项所得税工作落到实处。
二是强化所得税业务培训，提高操作技能。在内部培训工作上，要向所得税管理上倾斜，要坚持专业培训与业余学习相结合，使其在政策咨询、资料受理、税款征收等各个环节，与现代高效、快捷的税收管理相吻合。
三是改进征收鉴定方式。首先，统一与地税的征收方式、征收范围、核定标准，以及所得率的核定。其次，对应税所得率进行调整，使按照应税所得率征收所得税的企业，税负不高于同地区同行业的平均税负率，促进企业的健康发展。
四是加大税收执法力度。要在搞好正常检查工作的基础上，突出对重点行业的重点稽查，要充分利用现代化手段，建立人机结合的选案系统，对稽查工作中查出的问题，要依法及时处理，该处罚的要处罚，该曝光的要曝光，建立对偷税企业和处理结果进行公告制度，真正起到对各种偷税行为的威慑作用。
五是对目前享受减免税的各类企业，建立严格的认证审核制度，并组织全面清理检查。对于清理出的为骗取减免税的要按照偷税进行严肃处理。在涉外税收方面，也应对外商投资企业和外国企业进行清查，对虽以外商投资企业的名义进行注册登记，但外商投资不到位、不符合外商投资企业标准的企业，不再给予外商投资企业的税收优惠，改为适用内资企业所得税暂行条例，按内资企业缴税，以堵塞漏洞。
六是要加强财务监督，规范企业所得税管理。要结合企业所得税征收管理特点，根据自身征管现状，制订建立贯穿企业所得税征收管理全过程的一整套科学、合理、严密的企业所得税征收管理办法，要通过科学的财务监督，对资金投入、成本管理、利润核算一直到往来款项结算等各个环节，进行全方位监控，争取使企业所得税征管早日走上规范化的轨道，保证企业所得税收入稳定增长。